允许在永久基本农田上设立矿业权的情形包括：全国矿产资源规划明确的战略性矿产，以及地热、矿泉水等不造成永久基本农田损毁的非战略性矿产。

允许设立矿业权的矿产范围

在永久基本农田上，允许设立矿业权的矿产包括两类：一是全国矿产资源规划明确的战略性矿产；二是地热、矿泉水等不造成永久基本农田损毁的非战略性矿产。

永久基本农田划定前已设立矿业权的处理

非战略性矿产矿业权

在永久基本农田划定前已经设立的非战略性矿产矿业权，允许在原矿业权范围内办理延续变更等登记手续。

探矿权转采矿权

已取得探矿权申请探矿权转采矿权的，允许在落实保护性开采措施前提下，采取井下方式开采。