土壤宏基因组测序是针对土壤中细菌、真菌、古菌、原生动物、显微藻类等生物群落，通过从土壤样品中提取全部微生物的 DNA，分析功能宏基因的测序分析技术。用于构建宏基因组文库，分析土壤生物功能多样性。 词语的英文定义是soil metagenomic sequencing。
